Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms