Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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