Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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