Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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