Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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