Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms