Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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