Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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