Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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NFIAQ12857 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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