Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms