Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms