Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms