Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNB3Q05901 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms