Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRKCDQ05655 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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