Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms