Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms