Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMF1P82094 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMF1P82094 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms