Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP1S1P61966 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP1S1P61966 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms