Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms