Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms