Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCL1P53675 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms