Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC3P51654 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms