Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNTBP49356 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms