Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RABIFP47224 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RABIFP47224 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms