Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms