Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCAMP43121 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MCAMP43121 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms