Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MDH1P40925 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms