Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBRP36941 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms