Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC27P30260 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC27P30260 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC27P30260 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC27P30260 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC27P30260 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms