Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP1P29466 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms