Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCAP28676 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCAP28676 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms