Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms