Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5A1P25705 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5A1P25705 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5A1P25705 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms