Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CALB2P22676 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALB2P22676 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms