Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms