Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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