Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK4P11802 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK4P11802 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms