Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms