Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRP01130 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDLRP01130 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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