Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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CCNDBP1O95273 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCNDBP1O95273 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCNDBP1O95273 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNDBP1O95273 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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