Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms