Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCAO15360 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCAO15360 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCAO15360 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms