Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms