Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCRIP1C9JLW8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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