Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM3A6NNA2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms