Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms