Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1BQ9UPS6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms