Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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