Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RNF7Q9UBF6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RNF7Q9UBF6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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