Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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